來源:河北省衛(wèi)健委2020-03-24
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回望幾十天艱苦卓絕的戰(zhàn)“疫”歷程,社區(qū)防控和醫(yī)學(xué)救治之外,科學(xué)研究同樣是一條重要戰(zhàn)線。在這條戰(zhàn)線上,確定病原、建立動物模型,是開展所有后續(xù)研究的“基礎(chǔ)工事”。
回望幾十天艱苦卓絕的戰(zhàn)“疫”歷程,社區(qū)防控和醫(yī)學(xué)救治之外,科學(xué)研究同樣是一條重要戰(zhàn)線。在這條戰(zhàn)線上,確定病原、建立動物模型,是開展所有后續(xù)研究的“基礎(chǔ)工事”。
遞上軍令狀,50個小時拿出全部數(shù)據(jù)
1月2日,從武漢發(fā)來的不明原因肺炎患者的肺泡灌洗液樣本緊急運(yùn)抵北京。國家衛(wèi)生健康委向中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院病原生物學(xué)研究所等幾家單位下達(dá)任務(wù),要求即刻展開應(yīng)急科技攻關(guān),啟動背靠背病原學(xué)確證研究,找出導(dǎo)致不明原因肺炎疫情的“真兇”。
“面對新發(fā)突發(fā)傳染病,確定病原是展開應(yīng)急科研工作的首要任務(wù),不能確定病原,防控策略制定和應(yīng)急救治缺乏依據(jù),后續(xù)診斷手段、治療藥物及疫苗研發(fā)都將無的放矢?!敝袊t(yī)學(xué)科學(xué)院病原生物學(xué)研究所研究員、病原體鑒別實(shí)驗(yàn)室副主任任麗麗說,此次國家衛(wèi)生健康委指定了4家平行檢測機(jī)構(gòu),背靠背開展病原鑒定工作,得出一致結(jié)論,才能作為確定病原的依據(jù)。
幾家單位開始在這些樣本里抽絲剝繭,尋找可能存在的致病病原?!皫准覚z測單位拿到的是相同的樣本,來自相同的患者,目的就是看大家能否找到相同的答案?!比嘻慃愓f,病原所向中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院遞交了軍令狀,50個小時之內(nèi),拿出樣本中可能存在的病原微生物的基因組數(shù)據(jù)。
“采用的是宏基因組測序分析技術(shù),通過無偏移擴(kuò)增,來探查這些樣本中到底有哪些可能與疾病有關(guān)的病原。”任麗麗說,宏基因組技術(shù)是一種比較繁瑣復(fù)雜的基因測序技術(shù),在樣本制備、測序方法選擇、數(shù)據(jù)分析等方面都有很高的技術(shù)要求,“優(yōu)勢是可以拿到大量的數(shù)據(jù),只要能夠檢測出微生物,就能很好地拼接出它的基因組數(shù)據(jù);劣勢是針對此類病原發(fā)現(xiàn)應(yīng)急任務(wù)設(shè)計(jì)的完備方案比較累人,完成一次分析,需要研究人員約10個小時持續(xù)不間斷地建庫測序”。
“拿到樣本已是夜里,立即連夜在P3實(shí)驗(yàn)室開始處理樣本,提取核酸,開始測序工作?!比嘻慃愓f,為了在第一時間完成樣本的基因測序工作,所有參與項(xiàng)目的科研人員幾乎是幾十個小時沒合眼。
“每一個樣本的數(shù)據(jù)量都很大,在所有樣本的數(shù)據(jù)中都看到了同一種冠狀病毒的基因組序列,基于高質(zhì)量測序,直接就拼接出了這種冠狀病毒的全基因組序列,經(jīng)過深入分析,發(fā)現(xiàn)它是一種從未見感染過人類的新型冠狀病毒?!比嘻慃惐硎荆瑥慕◣?、上機(jī)測序到下機(jī)數(shù)據(jù)分析,直到給出最終報(bào)告,全部在不到50個小時內(nèi)完成。為確?;驍?shù)據(jù)的準(zhǔn)確性,研究團(tuán)隊(duì)同時還利用一代基因測序技術(shù)進(jìn)行了驗(yàn)證,“我們提交的是經(jīng)過驗(yàn)證的病毒全基因組數(shù)據(jù)”。
任麗麗表示,人類面對一種新的病原,不僅要知道它是什么,還要知道它的基因組特點(diǎn)是什么,“這種新發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒,它的每一段基因組序列與已知冠狀病毒有何差異,這些都要在報(bào)告中有詳細(xì)的分析”。
在國內(nèi)幾家科研單位的聯(lián)合攻關(guān)下,1月7日,病原檢測結(jié)果初步評估專家組組長、中國工程院院士徐建國向媒體表示,此次不明原因的病毒性肺炎病例的病原體初步判定為新型冠狀病毒。1月11日,國家衛(wèi)生健康委宣布,中國將與世界衛(wèi)生組織分享新型冠狀病毒基因序列信息,在中國首次分享的5株病毒基因組序列中,有1株是醫(yī)科院病原所提供的。
造成此次新發(fā)突發(fā)重大傳染病疫情的病原終于浮出水面。與17年前確認(rèn)SARS冠狀病毒耗時大半年不同,這種新型冠狀病毒的“落網(wǎng)”,只用了不到1周。2月11日,世界衛(wèi)生組織正式將這種新型冠狀病毒引起的疾病命名為“COVID-19”。
構(gòu)建動物模型,突破實(shí)驗(yàn)室到臨床瓶頸
病原基本確認(rèn)后,后續(xù)科研攻關(guān)的方向隨之確定,構(gòu)建動物模型成為所有科研工作的基礎(chǔ)。
基因測序顯示,新型冠狀病毒與SARS冠狀病毒具有很高的同源性。“我們根據(jù)生物信息學(xué)與結(jié)構(gòu)生物學(xué)分析推測,新型冠狀病毒很可能與SARS冠狀病毒一樣,通過人ACE2蛋白入侵機(jī)體?!敝袊t(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)動物研究所副所長劉江寧說,這一推測很快得到了科學(xué)研究的驗(yàn)證。
正是因?yàn)榉堑湟詠須v次傳染病動物模型攻關(guān)中的積累,醫(yī)科院動物模型科研團(tuán)隊(duì)在動研所所長秦川帶領(lǐng)下,1月10日完成了受體人源化小鼠、病原敏感SPF恒河猴、動物模型特異的病原檢測試劑、生物安全條件下的表型高通量實(shí)時分析技術(shù)等一系列技術(shù)準(zhǔn)備。通過與中國疾控中心病毒病所及院內(nèi)相關(guān)所院合作,1月29日建立小鼠模型、2月14日建立恒河猴模型,2月18日率先通過科技部組織的專家鑒定,突破了疫苗和藥物從實(shí)驗(yàn)室走向臨床應(yīng)用的技術(shù)瓶頸。
劉江寧說,此次應(yīng)急科研攻關(guān)能夠快速啟動,得益于國家傳染病防治重大專項(xiàng)、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與健康科技創(chuàng)新工程等長期以來的資助和支持,使醫(yī)科院動研所積累了“家底”,創(chuàng)建了現(xiàn)代化的突發(fā)傳染病動物模型應(yīng)急研制體系,保存有這種特殊小鼠模型的種子,“否則可能貽誤戰(zhàn)機(jī)”。
SARS期間,醫(yī)科院動研所成功研制了SARS冠狀病毒人源化受體轉(zhuǎn)基因小鼠模型。SARS疫情結(jié)束后,該所在繁衍保存少量SARS冠狀病毒人源化受體轉(zhuǎn)基因小鼠“種子”的同時,將更多的受精卵、胚胎等資源交由社會化液氮冷凍保存。
劉江寧說,在相關(guān)科研中,使用量最大的是人源化受體轉(zhuǎn)基因小鼠模型。疫情發(fā)生后,科研團(tuán)隊(duì)立即響應(yīng),一方面提取復(fù)蘇液氮冷凍保存的受精卵和胚胎,并進(jìn)行社會化繁育;一方面利用現(xiàn)有少量活體人源化轉(zhuǎn)基因小鼠“種子”展開應(yīng)急科研攻關(guān)。
“生物安全實(shí)驗(yàn)室也是疫情防控的戰(zhàn)場,而且可能是最危險(xiǎn)的戰(zhàn)場?!眲⒔瓕幷f,構(gòu)建動物模型的所有操作都要在P3實(shí)驗(yàn)室內(nèi)完成,科研人員要在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)對感染后的動物進(jìn)行各種處理,感染、拍胸片、采樣、解剖,都會頻繁接觸高濃度的病毒,“生病的動物行為焦躁,特別是猴子,一旦被抓傷、咬傷是很危險(xiǎn)的”。
劉江寧介紹,構(gòu)建動物模型是一項(xiàng)探索性的工作,若選錯了動物,動物模型失敗,整個科研攻關(guān)進(jìn)程都會被耽誤。因此,這是一項(xiàng)多種技術(shù)集成的工作,需要研發(fā)適合動物的檢測試劑和分析技術(shù)。動物模型研究是一個多專業(yè)聯(lián)合作戰(zhàn)的團(tuán)隊(duì),包括實(shí)驗(yàn)動物學(xué)、獸醫(yī)學(xué)、病理學(xué)、病毒學(xué)、免疫學(xué)、影像學(xué)、基因工程技術(shù)等各專業(yè)。
“我們也有遺憾,種子的數(shù)量還是太少。”劉江寧說,社會化冷凍保存的資源,要過一段時間才能經(jīng)過繁育后大批量供應(yīng)。劉江寧建議,在醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)動物資源這種戰(zhàn)略保障領(lǐng)域,我國應(yīng)建立國家中心,長期穩(wěn)定地支持資源建設(shè)和創(chuàng)新,“資源決定了科研的深度和廣度,決定了疫苗和藥物轉(zhuǎn)化的效率,也決定了應(yīng)急科研的效率,這樣才能確保有備無患”。
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